キャプテンを失ったまま、あてもなく空をさすらうイーグル空賊団の飛空艇。

そこに蛇人「ディープ・ベノム」率いる「ビッグ・ヴァイパー空賊団」が襲撃を仕掛けてきた。
戦った所で利益なしと、戦闘を離脱したのもつかの間、
イーグル空賊団が長きに渡って愛用していた飛空艇バートニアン号の船体に
限界がきていることを知る。

トベル臨時船長、ニュート、アンリエッテの３人は
ヴィクトリアシティの造船所「ブリストー工房」に、かつてキャプテンが新型飛空艇の建造を依頼していたことを聞き、
空賊の正体を隠してシティに潜入するのだった。

しかし、たどり着いた工房には、すでに蛇人ディープベノムが３人を待ち受けていて……！