日本を揺るがすテロ事件が勃発する中、デートの最中だった笠原郁と堂上篤に緊急招集がかかった。
新たな任務は、小説家・当麻蔵人の身辺警護。テロの手口に小説の内容が酷似しているとして、メディア良化委員会は作家狩りを始めたのだ。
法廷闘争が始まる中、郁たち図書特殊部隊は判決まで当麻を守りきらなければならない。
図書隊と良化隊の衝突が激化する中、重傷を負ってしまう堂上。動揺する郁に、堂上は任務の遂行を託す。
郁は、当麻を守り、表現の自由を守ることが出来るのか!? ――そして郁と堂上とのもどかしい恋の結末は!?

原作：有川浩「図書館戦争」シリーズ（角川文庫刊）
監督：浜名孝行
脚本：古怒田健志
キャラクター原案：徒花スクモ
キャラクターデザイン：中村 悟
美術監督：池田繁美
作画監督：齊藤卓也
音楽：菅野祐悟
主題歌：Base Ball Bear 「初恋」 （EMIミュージック・ジャパン）
特別協賛：日東紅茶
製作：図書館戦争フィルムパートナーズ 2012　
アニメーション制作：プロダクション I.G
配給：角川書店

笠原郁：井上麻里奈
堂上篤：前野智昭
柴崎麻子：沢城みゆき
手塚光：鈴木達央
小牧幹久：石田 彰
玄田竜助：鈴森勘司
児島清花：潘 めぐみ
当麻蔵人：イッセー尾形