ファイル鯖に使用しているPydioというWEBアプリのバージョンを5.2.2にアップグレードしました。
これまでバグだらけで色々面倒だったのですが、これでいくらか改善されるのではないかと思います。
ぱっと確認した所、公開リンク機能も復旧しているようです。

まぁ予想通りに動かないみたいな所はまだまだありますが、まぁ…ｗ

次回の制作までに別のWEBアプリに乗り変えたいところですが、はてさて。