怪獣娘（黒）ウルトラ怪獣擬人化計画 都会というほど騒がしくもなく、郊外というほど長閑でもない街、祖師ヶ谷大蔵。 怪獣娘たちの組織「GIRLS」に憧れながらも、ごく平凡な毎日を過ごしていた女子高生・平賀サツキ。 ある日、不思議な力に目覚め戸惑うサツキを助けてくれたのは、憧れの「GIRLS」…ではなくブラック指令と名乗る怪獣娘が率いる悪の軍団「BLACK STARS」だった!?

怪獣娘（第2期） ウルトラ怪獣擬人化計画 人類と怪獣との戦いは遠い昔。 かつての怪獣の魂を宿した少女”怪獣娘”たちが現れるようになった時代。 晴れてGIRLSの一員となったアギラ、ミクラス、ウインダムは着実に成長し、充実した日々を送っていた。 そんなある日、新種の「シャドウ」がトラブルを起こしているという情報が入る。 一方、GIRLSのメンバーの「ガッツ星人」は、不思議な体調の変化を感じていた……。

怪獣娘-ウルトラ怪獣擬人化計画- 人類と怪獣との長い戦いは終結し、平和が訪れた。 そんな時代に、怪獣の魂を宿し、怪獣の姿に変身できる少女“怪獣娘”たちが現れる。 そんな怪獣娘を集めて結成された特別組織“GIRLS”に、見習いとして配属されたアギラ、ミクラス、ウインダムの3人組。 立派な怪獣娘になるべく訓練にはげむデコボコトリオの明日はどっちだ……！？