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擾乱
時は明治64年。
舞台は94歳の徳川慶喜が絶対権力を維持し続けている日本。
街は明治時代の文化の色を残しつつも、
科学技術と陰陽道の発展が進み近未来的な雰囲気を醸し出していた。
しかし、きらびやかな街の裏には、慶喜暗殺すなわち体制の崩壊を目論んでいる輩
〜反体制派組織・クチナワ〜が影を潜めていた。
その駆除を任されたのは、政府の闇の処刑人組織『鵺（ぬえ）』。
鵺に所属する雪村咲羽（ゆきむらさわ）は幼い頃、クチナワの首領に家族を殺害され、
家族の仇を討つことを目的に生きていた。
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地獄先生ぬ-べ-
童守小学校に赴任してきた5年3組担任の鵺野鳴介、通称ぬ～べ～。普段の彼は、ドジでおっちょこちょいなところはあるが、どこか憎めない愛すべき先生として生徒たちに親しまれている。しかしぬ～べ～には、日本でただ一人の霊能力教師という、もう一つの顔があった。 常に黒い手袋で覆われている彼の左手には、この世ならざる存在――悪霊や妖怪などに直接触れて、浄化することのできる最強の力「鬼の手」が封印されているのだ。その力は、かつてある生徒を救うため、わが身を賭して封じ込めた地獄の鬼のものだった。
子供たちが「闇の住人」に襲われ、危機にさらされた時、ぬ～べ～必殺の「鬼の手」が闇を切り裂き、魔を祓う！
はたして今日はどんな怪事件や不思議な出来事が、ぬ～べ～を待ち受けているのだろうか？
