オキナワの北部に住む中学生・東道明は、姉の晴香、カフェを営む母親の3人で平穏な日常を送っていた。

だが、この家族にはある秘密があった。
晴香は父から"エンジン"と呼ばれる力を受け継いでおり、他人にその力を隠して生活していたのだ。
一方、明は父の力を継いでおらず、自らの弱さにコンプレックスを抱いていた。

そんな中、“パワーダウン”と呼ばれる世界中のネットワークが麻痺する現象が起こる。
不便さを感じながら日常を送っていた明たちだったが、突如晴香の額が赤く光る。
それは、かつてEDVAが地球に迫ったとき、父の身に起きたのと同じ現象だった――。

宇宙の命運を背負った少年少女の戦いが、いま始まる。