インデックスの負債総額が約240億円程度ですから、半分近い負債金額を買収金としてセガ（セガサミー）として拠出したことになります。
おそらくは里見さんのジャッジでしょうが、落合さんと関係性による金額だと思います。  
里見さんも相当な苦労人です。お父さんから受けついだ工場を再建して、一代でサミーを世界規模の会社にしたかたです。落合さんは埼玉の川口市出身、「キューポラのある町」の出身です。苦学をされて慶応大学に入学、日商岩井に就職されたというお話は何度もご本人からも聞きました（「恋愛の神様」という本にも詳しいです）。  
そんな経緯もあって、おそらく里見さんから「落合、大変だったな・・・（民事再生の件は）応援するから、もう一回がんばれ」というエールを含んだ買収金額だと思います。
ちなみに、その理由は私がデックスエンタテインメントを起業した際には50％の資本金をインデックスの落合さんから出してもらいましたが、10数％をマーベラスエンターテイメント(当時)からも出してもらっていました。
すると、後日談ですが・・・・落合さんのインデックスの社長室で

アトラスに話を戻しますが・・・・結論から言えばカネのあるところは早く買ってあげてよ！というシンプル提言です。

 
その候補としては ( 個人的なものですが・・・）

 
候補１・セガ　または　セガネットワークス

ま、キャッシュもセガサミーグループだしあるだろうし、里見（ジュニア）治紀さんの体制強化ならびにジュニア（シニアは里見治オーナーとして）の後継体制のためにもいいんじゃないでしょうかね。

 
 
候補２・マーベラスＡＱＬ

こちらも、シニア中山隼雄さまもお元気だし、日本で一番の現金資産をもっているし、最近も久夛良木さんを社外役員い迎えたのもシニア中山だし、アトラスのコンテンツのミュージカル版の運営もやっていたりしますし・・・ま、厳しくも温かいコンテンツへの愛のある組織ってことですね。

その2年ほどあとになりますが、Ｔさんもインデックスグループを離れたと聞きましたが、インターチャネル社の有力なコンテンツを切り出して、ＮＩＳ系の資金ファンドか日興系ファンドの資金を入れて新規で会社を立ち上げました。一説にはインデックスの落合さんと水面下で未公開株の取引をしてキャッシュを握ったという噂もあります。またＴさんに関しては海外に子会社を作って、その売り上げを循環して自分の個人会社に入れているという噂もありました。プチ・インデックスのようなことをやっていたのではないでしょうか。